Apesar de ser um tema não muito discutido no Terceiro Setor, também existem ONGs que tratam da paternidade responsável. Um exemplo é o programa Papai, de Recife, que desenvolve pesquisas e ações socioeducativas com homens de diversas idades. O projeto ainda leva conhecimentos sobre o tema aos jovens e realiza atividades de sensibilização. Outra iniciativa vem da ONG Ecos, de São Paulo, que trabalha questões que envolvem o vírus HIV e o homem na missão da prevenção.