A Lei 10.688/03 autorizou a plantação de soja transgênica. No dia 20 de outubro, 500 ONGs ambientalistas enviaram ao presidente Lula carta solicitando medidas urgentes para garantir a sustentabilidade do País. As organizações temem que as obras anunciadas no Plano Plurianual (PPA) de 2004-2007 prejudiquem o meio ambiente, principalmente na região Amazônica, além de se declararem inconformadas com a expansão da fronteira agrícola para área de floresta no norte brasileiro, com a liberação de plantio de transgênicos.